Ο Αθανάσιος Σταυρακούδης υπηρετεί την τριτοβάθμια εκπαίδευση από το 2000, διδάσκοντας πληροφορική και τεχνολογία σε σχολές οικονομίας και διοίκησης. Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα περιλαμβάνουν υπολογιστική προσομοίωση, ανάλυση χρονολογικών σειρών, ιστορικές βάσεις δεδομένων, παράλληλη επεξεργασία και έξυπνα συστήματα. Έχει συμμετάσχει σε ερευνητικά έργα και δημοσιεύσεις, συνδέοντας την τεχνολογία με οικονομικές εφαρμογές και υποστηρίζοντας την καινοτομία. Είναι διευθυντής του Εργαστηρίου Εφαρμογών Πληροφορικής και Υπολογιστικών Οικονομικών.